Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H60cB1B213 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
H60cB1B213 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
H60cB1B213 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms