Protein–RNA interactions for Protein: A7XUZ6

Skint6, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint6A7XUZ6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Skint6A7XUZ6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Skint6A7XUZ6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms