Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-M5A7VMS3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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