Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atp8b5A3FIN4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp8b5A3FIN4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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