Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GabreA2AMW3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms