Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ccdc163A2AGD7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ccdc163A2AGD7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms