Protein–RNA interactions for Protein: A2A9T0

Tbkbp1, TANK-binding kinase 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbkbp1A2A9T0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbkbp1A2A9T0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbkbp1A2A9T0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms