Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm17190V9GX38 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17190V9GX38 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms