Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm4T1NXB5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms