Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Top3bQ9Z321 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Top3bQ9Z321 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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