Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krt27Q9Z320 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms