Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vamp5Q9Z2P8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vamp5Q9Z2P8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vamp5Q9Z2P8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Vamp5Q9Z2P8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vamp5Q9Z2P8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Vamp5Q9Z2P8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vamp5Q9Z2P8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms