Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Mbd3Q9Z2D8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms