Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RfxankQ9Z205 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RfxankQ9Z205 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms