Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn3Q9Z0G9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn3Q9Z0G9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn3Q9Z0G9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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