Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PapolbQ9WVP6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms