Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnip1Q9WUU8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnip1Q9WUU8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms