Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vav3Q9R0C8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vav3Q9R0C8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms