Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf4Q9QZS2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf4Q9QZS2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf4Q9QZS2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf4Q9QZS2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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