Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col4a3Q9QZS0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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