Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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Rdh11Q9QYF1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rdh11Q9QYF1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rdh11Q9QYF1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Rdh11Q9QYF1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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Rdh11Q9QYF1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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