Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Trappc2lQ9JME7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms