Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Chrac1Q9JKP8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Chrac1Q9JKP8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
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