Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gfra4Q9JJT2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gfra4Q9JJT2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms