Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Riox1Q9JJF3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Riox1Q9JJF3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms