Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lmbr1Q9JIT0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmbr1Q9JIT0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms