Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1fQ9JIS7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms