Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmod3Q9JHJ0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms