Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trim39Q9ESN2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim39Q9ESN2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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