Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
OtofQ9ESF1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
OtofQ9ESF1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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