Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ParvbQ9ES46 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms