Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms