Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clstn1Q9EPL2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clstn1Q9EPL2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms