Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pak1ip1Q9DCE5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms