Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnot8Q9D8X5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnot8Q9D8X5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms