Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms