Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Capns2Q9D7J7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Capns2Q9D7J7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Capns2Q9D7J7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Capns2Q9D7J7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Capns2Q9D7J7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capns2Q9D7J7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Capns2Q9D7J7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Capns2Q9D7J7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns2Q9D7J7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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