Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nop56Q9D6Z1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop56Q9D6Z1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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