Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms