Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus10Q9D3U0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms