Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms