Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snrnp35Q9D384 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snrnp35Q9D384 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms