Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X0

Ankrd39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd39Q9D2X0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ankrd39Q9D2X0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms