Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pramef12Q9D2F1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pramef12Q9D2F1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pramef12Q9D2F1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms