Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zbed3Q9D0L1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zbed3Q9D0L1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zbed3Q9D0L1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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