Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cnih4Q9CX13 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms