Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms