Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smurf1Q9CUN6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smurf1Q9CUN6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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