Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fcf1Q9CTH6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Fcf1Q9CTH6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Fcf1Q9CTH6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcf1Q9CTH6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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