Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snw1Q9CSN1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms